Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCF4Q15080 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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