Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms