Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms