Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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