Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC10A1Q14973 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms