Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSPNQ14714 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms