Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms