Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SPIDRQ14159 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SPIDRQ14159 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SPIDRQ14159 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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SPIDRQ14159 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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SPIDRQ14159 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SPIDRQ14159 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms