Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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