Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNC3Q14003 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms