Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms