Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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CUL4AQ13619 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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