Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
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