Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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