Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FOXO1Q12778 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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FOXO1Q12778 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FOXO1Q12778 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXO1Q12778 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXO1Q12778 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXO1Q12778 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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FOXO1Q12778 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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