Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SREBF2Q12772 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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