Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms