Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms