Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms