Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms