Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA3Q08378 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms