Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms