Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms