Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms