Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms