Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms