Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms