Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms