Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPCQ01831 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPCQ01831 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPCQ01831 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPCQ01831 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms