Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OTUD4Q01804 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms