Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms