Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms