Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIM1P81133 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIM1P81133 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIM1P81133 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms