Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL7P80098 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL7P80098 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL7P80098 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms