Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms