Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VBP1P61758 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms