Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms