Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms