Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSCP56915 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSCP56915 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GSCP56915 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSCP56915 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms