Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms