Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRE11P49959 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MRE11P49959 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRE11P49959 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRE11P49959 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms