Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOPP49908 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms