Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMPHP49418 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMPHP49418 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMPHP49418 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMPHP49418 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMPHP49418 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMPHP49418 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMPHP49418 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms