Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms