Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms