Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms