Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THBS4P35443 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THBS4P35443 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms