Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms