Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms