Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms